Épisode 1 : Défier le soleil
Date de la première diffusion : 04/10/2003
Épisode 2 : Le corps d'un condamné
Date de la première diffusion : 11/10/2003
Épisode 3 : Maman
Date de la première diffusion : 18/10/2003
Épisode 4 : Le trafiquant d'âmes
Date de la première diffusion : 25/10/2003
Épisode 5 : L'homme au bras bionique
Date de la première diffusion : 01/11/2003
Épisode 6 : L'examen d'entrée
Date de la première diffusion : 08/11/2003
Épisode 7 : Les cris de la chimère
Date de la première diffusion : 15/11/2003
Épisode 8 : La Pierre Philosophale
Date de la première diffusion : 22/11/2003
Épisode 9 : Au service du peuple
Date de la première diffusion : 29/11/2003
Épisode 10 : La voleuse fantôme
Date de la première diffusion : 06/12/2003
Épisode 11 : Faux frères - 1re partie
Date de la première diffusion : 13/12/2003
Épisode 12 : Faux frères - 2e partie
Date de la première diffusion : 20/12/2003
Épisode 13 : Flamme vs Fullmetal
Date de la première diffusion : 27/12/2003
Épisode 14 : Le bras droit destructeur
Date de la première diffusion : 10/01/2004
Épisode 15 : Le massacre d'Ishbal
Date de la première diffusion : 17/01/2004
Épisode 16 : Ce qu'on a perdu
Date de la première diffusion : 24/01/2004
Épisode 17 : La maison familiale
Date de la première diffusion : 31/01/2004
Épisode 18 : Les notes de Marcoh
Date de la première diffusion : 07/02/2004
Épisode 19 : Toute la vérité
Date de la première diffusion : 14/02/2004
Épisode 20 : Ame de gardien
Date de la première diffusion : 21/02/2004
Épisode 21 : La lueur rouge
Date de la première diffusion : 28/02/2004
Épisode 22 : Les Homonculus
Date de la première diffusion : 06/03/2004
Épisode 23 : Cœur d'acier
Date de la première diffusion : 13/03/2004
Épisode 24 : Souvenirs enracinés
Date de la première diffusion : 20/03/2004
Épisode 25 : Cérémonie d'adieu
Date de la première diffusion : 27/03/2004
Épisode 26 : Au pays des auto-mails
Date de la première diffusion : 03/04/2004
Épisode 27 : Maître
Date de la première diffusion : 10/04/2004
Épisode 28 : Un est tout, tout est un
Date de la première diffusion : 17/04/2004
Épisode 29 : Un enfant innocent
Date de la première diffusion : 24/04/2004
Épisode 30 : Attaque du QG Sud
Date de la première diffusion : 01/05/2004
Épisode 31 : Le péché
Date de la première diffusion : 08/05/2004
Épisode 32 : Dante
Date de la première diffusion : 15/05/2004
Épisode 33 : Al se fait enlever
Date de la première diffusion : 29/05/2004
Épisode 34 : La théorie de Greed
Date de la première diffusion : 05/06/2004
Épisode 35 : Retrouvailles
Date de la première diffusion : 12/06/2004
Épisode 36 : Tueurs-nés
Date de la première diffusion : 19/06/2004
Épisode 37 : L'alchimiste de flamme
Date de la première diffusion : 26/06/2004
Épisode 38 : Le lit de la rivière
Date de la première diffusion : 03/07/2004
Épisode 39 : Guerre civile dans l'Est
Date de la première diffusion : 10/07/2004
Épisode 40 : La cicatrice
Date de la première diffusion : 17/07/2004
Épisode 41 : La sainte
Date de la première diffusion : 24/07/2004
Épisode 42 : De nom inconnu
Date de la première diffusion : 31/07/2004
Épisode 43 : Chien errant
Date de la première diffusion : 07/08/2004
Épisode 44 : Hohenheim le Lumineux
Date de la première diffusion : 14/08/2004
Épisode 45 : Cœur corrompu
Date de la première diffusion : 21/08/2004
Épisode 46 : Transmutation humaine
Date de la première diffusion : 28/08/2004
Épisode 47 : Sceller un Homunculus
Date de la première diffusion : 04/09/2004
Épisode 48 : Adieu
Date de la première diffusion : 11/09/2004
Épisode 49 : Derrière la porte
Date de la première diffusion : 18/09/2004
Épisode 50 : La mort
Date de la première diffusion : 25/09/2004
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